Simulation Search Results
Filtered by:
- Iones: CLA
| ID ▲ | Temperature (K) ▲▼ | Length (ps) ▲▼ | Area per lipid ▲▼ | OP Quality: total ▲▼ | Form factor quality ▲▼ | Quality: headgroups, tails | Software | Force field | Lipids | Ions | Experimental Data | Actions |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 530 | 310 | 100010 | 65.04 | N/A | N/A |
|
gromacs | GROMOS-CKP-POPG-Tom_Piggot-v1 | POPG | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 531 | 298 | 999520 | 61.37 | N/A | N/A |
|
gromacs | ECC-lipids, SPC/E water model, ECC-ions | POPS, POPC | CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD, CAL, CLA, SOD | No | View |
| 534 | 310 | 2000100 | 49.8 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids with default Amber ions parameters (type C0) | CHOL, POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 536 | 323 | 120020 | 62.56 | N/A | N/A |
|
gromacs | Berger-DPPC-98 | DPPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 538 | 298 | 1000100 | 56.95 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids | POPG, POPC | CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD, CLA, CAL, SOD | No | View |
| 540 | 298 | 1000020 | 60.73 | N/A | N/A |
|
gromacs | Lipid17 and Dang ions | POPS, POPC | SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA | No | View |
| 542 | 300 | 500100 | 52.98 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids | DPPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 544 | 303 | 60010 | 61.15 | N/A | N/A |
|
gromacs | CHARMM36 | POPC | CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD | No | View |
| 557 | 350 | 800100 | 64.48 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids with ECC-scaled ions (Kohagen) | POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 559 | 310 | 100100 | 63.64 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids for lipids, Kohagen for NaCl | POPC | CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD | No | View |
| 560 | 298 | 120010 | 63.21 | N/A | N/A |
|
gromacs | Orange | POPC | CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD | No | View |
| 561 | 310 | 100010 | 59.02 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids | POPE | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 565 | 303 | 100010 | 60.22 | N/A | N/A |
|
gromacs | CHARMM36 | POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 567 | 310 | 300100 | 59.95 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids | DPPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 569 | 310 | 200100 | 51.55 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids with ions by Smith & Dang | CHOL, POPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |