Simulation Search Results
Filtered by:
- Iones: CLA
| ID ▲ | Temperature (K) ▲▼ | Length (ps) ▲▼ | Area per lipid ▲▼ | OP Quality: total ▲▼ | Form factor quality ▲▼ | Quality: headgroups, tails | Software | Force field | Lipids | Ions | Experimental Data | Actions |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 303 | 100010 | 60.54 | N/A | N/A |
|
gromacs | CHARMM36 | POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 324 | 298 | 150010 | 60.17 | N/A | N/A |
|
gromacs | CHARMM36 | POPS, POPC | CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD | No | View |
| 331 | 323 | 110010 | 60.98 | N/A | N/A |
|
gromacs | Berger with DMTAP modification by Gurtovenko et al. | DMPC, DMTAP | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 332 | 310 | 500100 | 45.12 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids | CHOL, DPPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 333 | 310 | 300100 | 45.01 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids | CHOL, DPPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 336 | 313 | 180010 | 54.87 | N/A | N/A |
|
gromacs | Lipid14 | POPC, DHMDMAB | CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA, CLA | No | View |
| 337 | 298 | 1000020 | 61.5 | N/A | N/A |
|
gromacs | ECC-lipids | POPS, POPC | SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA, SOD, POT, CLA | No | View |
| 339 | 310 | 2000100 | 54.73 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids with default Amber ions parameters (type C0) | CHOL, POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 342 | 338 | 500100 | 61.32 | N/A | N/A |
|
gromacs | CHARMM36 | DSPC | CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD | No | View |
| 343 | 323 | 120020 | 66.39 | N/A | N/A |
|
gromacs | OPLSAA-compatible Berger-DPPC-06 | DPPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 346 | 310 | 200100 | 67.79 | N/A | N/A |
|
gromacs | Slipids for lipids and Smith & Dang for ions | DOPC | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 347 | 313 | 133220 | 61.76 | N/A | N/A |
|
gromacs | ECC-lipids | POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 348 | 310 | 100010 | 60.63 | N/A | N/A |
|
gromacs | GROMOS-CKP | POPE, POPG | SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA | No | View |
| 350 | 313 | 300000 | 62.02 | N/A | N/A |
|
gromacs | ECC-lipids | POPC | CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA, CAL, CLA | No | View |
| 351 | 310.15 | 352300 | 59.37 | N/A | N/A |
|
gromacs | ECC-CHARMM36 | POPC | CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD, CLA, SOD | No | View |